หลังมีนักท่องเที่ยวถูกลอยแพ เพราะสายการบินปฎิเสธที่จะขึ้นบิน นายสมชาย พิพุธวัฒน์ อธิบดีกรมการบินพลเรือน แจ้งผ่านจส. 100 ว่า เป็นเพราะสายการบินบิสซิเนส แอร์ ถูกระงับการบิน เนื่องจากผิด สัญญาค้างค่าบริการควบคุมการจราจรทางอากาศกับบริษัทวิทยุการบินแห่งประเทศไทยกว่า 17 ล้านบาท ซึ่งกรมการบินพลเรือนได้ผ่อนผันให้บินได้ตั้งแต่วันที่ 1-15 มกราคม2558 เท่านั้น จากการตรวจสอบพบว่า บริษัท ได้ยกเลิกเที่ยวบินจากกรุงเทพฯ ไปอินชอน เกาหลีใต้ จากนั้นบริษัททัวร์ได้ซื้อบัตรโดยสารของสายการบินอื่นให้กับผู้โดยสารแล้ว คงมีผู้โดยสารตกค้างที่อินชอนประมาณ 750 ซึ่งบริษัททัวร์ได้ซื้อบัตรโดยสารเที่ยวบินประจำให้แล้วประมาณ 300คน คงเหลือผู้โดยสารที่จะต้องดำเนินการให้เดินทางกลับมายังไทยอีกประมาณ 450คน ได้ กรมการบินพลเรือนได้ประสานกับทางบริษัทการบินไทย จำกัด (มหาชน) ให้รับผู้โดยสารกลับ เมื่อได้รับการประสานจากบริษัทฯ
ก่อนหน้านี้ กรมการบินพลเรือนได้ตรวจสอบสถานะการเงิน พบว่า บริษัทฯ มีปัญหาในการจัดหาเงินทุนหมุนเวียนที่จะนำมาใช้เสริมสภาพคล่องในการประกอบธุรกิจรวมทั้งมีความสามารถสร้างกระแสเงินสดเพื่อนำมาชำระหนี้ที่มีอยู่ได้ค่อนข้างจึงได้เชิญบริษัทฯ มาประชุมหารือร่วมกับบริษัทวิทยุการบินแห่งประเทศไทย จำกัดโดยบริษัทฯ ต้องจัดทำแผนสำรองหากเกิดกรณีอากาศยานขัดข้องไม่สามารถให้บริการได้ รวมทั้งต้องชำระค่าบริการควบคุมจราจรทางอากาศให้บริษัทวิทยุการบินแห่งประเทศไทย จำกัด ในเบื้องต้นจำนวนร้อยละ 33 ของหนี้ที่เกิดขึ้นตั้งแต่ วันที่ 28 เมษายน ถึงวันที่ 30 พฤศจิกายน 2557 และต้องชำระค่าบริการควบคุมการจราจรทางอากาศเป็นเงินสด รายเที่ยว คิดเป็นเงินประมาณ 100,000 บาทต่อเที่ยว (ไปและกลับ)
หากบริษัทฯ ไม่ดำเนินการให้เสร็จสิ้นภายในเวลาที่กำหนด บริษัทฯ ยินยอมให้ทางราชการดำเนินเพิกถอนใบอนุญาตให้ประกอบกิจการค้าขายในการเดินอากาศต่อไป ซึ่งกรมการบินพลเรือนได้พิจารณาผ่อนผันอนุญาตเป็นครั้งสุดท้าย ให้บริษัทฯ นำอากาศยานทำการบินต่อไปอีก ตั้งแต่วันที่ 1 – 15 มกราคม 2558 โดยมีเงื่อนไขว่า บริษัทฯ ต้องชำระค่าบริการควบคุมการจราจรทางอากาศให้กับบริษัทวิทยุการบินแห่งประเทศไทย จำกัด เป็นเงินสดจำนวน 17,366,188.80 บาท (สิบเจ็ดล้านสามแสนหกหมื่นหกพันหนึ่งร้อยแปดสิบแปดบาทแปดสิบสตางค์)แต่บริษัทฯ มิได้ดำเนินการตามที่ได้ตกลง
ด้านบริษัท บิสซิเนส แอร์ ชี้แจงผ่านเฟซบุ๊ค ว่า กรมการบินพลเรือน เป็นผู้ขัดขวางการขึ้นบิน ซึ่งบริษัทได้พยายามดำเนินการทุกวิถีทางอย่างสุดความสามารถ และในวันที่ 13 มกราคม 2558 บริษัทฯ ได้นำข้อพิพาท เรื่องการจ่ายเงินให้กับวิทยุการบินร้องต่อศาลปกครองกลาง เพื่อให้มีการไต่สวนฉุกเฉิน และมีคำสั่งคุ้มครองชั่วคราว ศาลปกครองกลางมีคำสั่งนัดไต่สวนในวันจันทร์ที่ 19 มกราคม 2558 ในขณะที่เงื่อนไขของกรมการบินพลเรือนจะมีผลในวันที่ 15 มกราคม 2558 ซึ่งโดยมารยาทแล้ว หน่วยงานราชการดังกล่าวควรต้องรอก่อน