ศาลปกครองกลาง มีคำพิพากษาเพิกถอนคำชี้ขาดอนุญาโตตุลาการ เมื่อวันที่ 20 ธ.ค.2556 ที่สั่งให้การทางพิเศษแห่งประเทศไทย (กทพ.) ชำระเงินค่าก่อสร้างและค่าใช้จ่ายต่างๆในการดำเนินการก่อสร้างโครงการระบบทางด่วนขั้นที่ 2 ศาลปกครองให้เหตุผลในการพิพากษาเพิกถอนว่า ข้อเท็จจริงในคดีนี้ รับฟังได้ว่า บมจ.บีอีเอ็ม ยื่นเสนอข้อพิพาทกรณีเงินค่าก่อสร้างและค่าใช้จ่ายต่างๆในการดำเนินการก่อสร้างโครงการระบบทางด่วนขั้นที่ 2 ในส่วนงานที่มีการเปลี่ยนแปลงเพิ่ม3 จุด ได้แก่ จุดเชื่อมต่อถนนงามวงศ์วาน จุดเชื่อมต่อถนนแจ้งวัฒนะ และจุดเชื่อมต่อถนนพระราม9 ต่อคณะอนุญาโตตุลาการ เมื่อวันที่ 9 ธ.ค.2552 เป็นการยื่นคำเสนอข้อพิพาทต่ออนุญาโตตุลาการพ้นกำหนดระยะเวลา5 ปีนับแต่วันที่ บมจ.บีอีเอ็ม รู้ถึงเหตุข้อพิพาทกับ กทพ. เมื่อวันที่ 19 ม.ค.2543 ดังนั้นการที่อนุญาโตตุลาการรับข้อพิพาทดังกล่าวเมื่อพ้นกำหนดระยะเวลาที่กฎหมายกำหนด คำวินิจฉัยชี้ขาดดังกล่าวจึงเป็นคำชี้ขาดที่ไม่ชอบด้วยกฎหมาย ขัดต่อความสงบเรียบร้อยและศีลธรรมอันดีของประชาชน พิพากษาเพิกถอนคำชี้ขาดอนุญาโตตุลาการ