กรณีการบูรณปฏิสังขรณ์พระปรางค์วัดอรุณราชวราราม พระศากยปุตติยวงศ์ (ต่อศักดิ์ สุนทรวาที) ผู้ช่วยเจ้าอาวาสวัดอรุณราชวรารามราชวรมหาวิหารแจ้งว่า ชิ้นส่วนที่นำลงมาเป็นชิ้นส่วนกระเบื้องที่เสียหาย ขนาดนิ้วคูณนิ้ว ขอบบิ่นบ้าง เหมือนโมเสส ไม่ได้มากมายอะไร ชิ้นส่วนที่ดูได้ก็เก็บเอาไว้ ไม่ได้นำไปทิ้งแต่อย่างใด บางส่วนก็แปรสภาพเป็นพระ หรือเป็นวัตถุมงคลมอบให้คนที่มาทำบุญ เหมือนวัดอื่นๆที่ทำกัน ส่วนที่ว่าเป็นพวกจานชามไม่ได้มีการนำลงมาเลย และไม่อยากให้เป็นประเด็น
กระเบื้องสีที่นำขึ้นไปประดับบนองค์พระปรางค์ เป็นการซ่อมเปลี่ยนแทนวัสดุเดิม ส่วนพระปรางค์ของเดิมก่อนการบูรณะนั้น จะมีสีออกดำเกิดจากคราบตะไคร่และเชื้อรา จึงทำการซ่อมล้าง เอาสิ่งของที่เสื่อมสภาพออก ไป และจำเป็นต้องใช้ของใหม่ปิดทับ ส่วนที่เป็นของดั้งเดิมที่ยังคงสภาพดี เรายังคงไว้สภาพเดิม จึงขอยืนยันว่า สภาพพระปรางค์ที่เก่าแก่สมัยเดิมเป็นสีขาวชัดเจน แต่เมื่อเวลาผ่านไปเป็นเวลานาน จึงเกิดคราบตะไคร่ ทำให้พระปรางค์มีสีเขียวขุ่นเกาะติดมาเป็นเวลานาน พอทำความสะอาดคราบตะไคร่น้ำและทาสีน้ำปูน จึงทำให้พื้นหลักเป็นสีขาว ตามพระปรางค์แบบดั้งเดิม ส่วนเศษวัสดุจำพวกเศษกระเบื้องที่ผุพังหรือเศษปูนปั้นจากพระปรางค์ ถูกนำไปเก็บไว้ เพื่อใช้ประโยชน์ในวันข้างหน้า เช่น นำไปจัดแสดงในพิพิธภัณฑ์ ดีกว่านำไปทิ้ง