พ.อ. วินธัย สุวารี รองโฆษกกองทัพบก (ทบ.) และทีมโฆษกคณะรักษาความสงบแห่งชาติ (คสช.) ชี้แจงกรณีที่มีข่าวว่าไทยไม่จริงใจในการสานต่อการพูดคุยสันติภาพ เพราะไม่มีการพูดถึงเขตปกครองพิเศษและแบ่งแยกดินแดน ว่าที่ผ่านมาไทยได้ยึดถือหลักตามรัฐธรรมนูญ มาตรา 1 ที่ว่าประเทศไทยแบ่งแยกไม่ได้ ทั้งในเรื่องของเขตแดนและการปกครองมาตลอด โดยสำหรับเมืองพัทยา หรือกรุงเทพมหานครนั้น ไม่ใช่เขตปกครองพิเศษ แต่เป็นการปกครองแบบพิเศษเพื่อเศรษฐกิจและการท่องเที่ยว มิใช่เขตปกครองพิเศษ ซึ่งแสดงให้เห็นว่าความไม่จริงใจที่บางคนกล่าวอ้างไม่ใช่จากฝ่ายไทย สิ่งที่ไทยจะแก้ไขให้คือข้ออ้างในเรื่องความไม่เป็นธรรม และความไม่ชอบธรรมต่างๆ ที่ผู้เห็นต่างได้เรียกร้องและได้กล่าวอ้างถึง
อย่างไรก็ตาม มีรายงานว่าแกนนำกลุ่มผู้เห็นต่างจากรัฐซึ่งมีความใกล้ชิดกับ นายฮัสซัน ตอยิบ อดีตหัวหน้าคณะพูดคุยสันติภาพฝ่ายบีอาร์เอ็น และสามารถประสานงานกับแกนนำทั้งบีอาร์เอ็นและพูโล รู้สึกยินดีที่ คสช.เตรียมฟื้นกระบวนการพูดคุยสันติภาพขึ้นมาใหม่ แต่ก็กังวลที่มีรายงานข่าวทางสื่อมวลชนว่า ประเด็นการปกครองตนเอง หรือ เขตปกครองตนเองแบบพิเศษ (autonomy) จะไม่ถูกหยิบขึ้นโต๊ะพูดคุยเพื่อหาทางออกอย่างเด็ดขาด ถือเป็นการส่งสัญญาณที่ผิด และส่งผลที่กระทบต่อกระบวนการพูดคุย