นายพนม ศรศิลป์ ผอ.สำนักงานพระพุทธศาสนาแห่งชาติ (พศ.) ในฐานะเลขาธิการมหาเถรสมาคม(มส.) ยืนยันว่า ในวันประชุมมหาเถรสมาคม ที่ 20 ก.พ.นี้ ที่ประชุม ไม่ได้ มีมติ เกี่ยวกับ พระธัมมชโย ไม่ปราชิก ตามที่มีการเผยแพร่ข่าวออกไปมีแต่เพียงการนำผลการชี้แจงที่นายสมเกียรติ ธงศรี ผอ.สำนักเลขาธิการมหาเถรสมาคม ที่นำมติมส.ปี 2549 เกี่ยวกับกรณีวัดพระธรรมกายที่นำไปชี้แจงยังคณะกรรมการปฏิรูปแนวทางและมาตรการปกป้องพิทักษ์กิจการพระพุทธศาสนา มารายงานให้มส.ได้รับทราบเท่านั้น
อย่างไรก็ตาม ในการประชุม วันนั้น ผู้ที่ออกมาแถลงต่อสื่อถึงมติที่ประชุมมส คือ พระพรหมเมธี(จำนงค์ ธมฺมจารี) กรรมการและโฆษกมส. ที่ออกมาเปิดเผยต่อสื่อมวลชนว่า ที่ประชุมมส.ได้มีมติรับทราบกรณีนายสมเกียรติ ธงศรี ผอ.สำนักเลขาธิการมหาเถรสมาคม (มส.) เป็นผู้แทนสำนักงานพระพุทธศาสนาแห่งชาติ (พศ.) ไปชี้แจงกับคณะกรรมการปฏิรูปแนวทางและมาตรการปกป้องพิทักษ์กิจการพระพุทธศาสนา สปช. กรณีพระเทพญาณมหามุนี หรือหลวงพ่อธมฺมชโย เจ้าอาวาสวัดพระธรรมกายได้มีการละเมิดพระลิขิตสมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช สกลมหาสังฆปริณายก ในปี 2542 หรือไม่ จากนั้น มส.ได้พิจารณาถึงเจตนาของหลวงพ่อธมฺมชโย ว่าฝ่าฝืนพระลิขิตสมเด็จพระสังฆราชหรือไม่ ซึ่งที่ประชุมมส.ได้ยกมติมส.ในปี 2549 ขึ้นมาพิจารณาแล้วเห็นว่า หลวงพ่อธมฺมชโย ยอมรับและปฏิบัติตามพระลิขิตของสมเด็จพระสังราชในการคืนที่ดินทุกประการ ดังนั้นสถานภาพปัจจุบันของหลวงพ่อธมฺมชโย ยังคงดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาสวัดและดำรงสมณศักดิ์เช่นเดิม
อีกด้านหนึ่ง นายไพศาล พืชมงคล กรรมการผู้ช่วยรองนายกรัฐมนตรี (พล.อ.ประวิตร วงษ์สุวรรณ) โพสต์ข้อความลงในเฟซบุ๊กส่วนตัว Paisal Puechmongkol ว่า "เพิ่งได้ทราบข่าวว่า สำนักพุทธศาสนาแห่งชาติแถลงอีกแล้วว่า ในการประชุมล่าสุด มหาเถรสมาคมไม่ได้มีมติอะไร ไม่ได้มีมติว่า 'ธัมมชโย' ไม่เป็นปาราชิกดังที่เป็นข่าว ดังนั้น ขอร้องท่านทั้งหลายอย่าได้ติเตียนมหาเถรสมาคมโดยส่วนรวม อย่าได้ติเตียนกรรมการมหาเถรสมาคมไปหมดทุกรูป จะกระทบองค์กรคณะสงฆ์มาก กรรมการมหาเถรสมาคมฝ่ายธรรมยุต 8 รูป ยืนยันตามพระบัญชาสมเด็จพระญาณสังวรณ์สมเด็จพระสังฆราช ลงวันที่ 26 เมษายน 2542 และมติมหาเถรสมาคม ที่ 193/42 เรื่องปาราชิกว่าเป็นปาราชิกแน่นอน อ้างอิง ถึง ท่านเจ้าคุณพรหม วัดยานนาวา ยืนยันกับท่านผู้ใหญ่ว่า ไม่มีมติอะไรและท่านก็ไม่ได้พูดอะไรด้วยสมเด็จวัดปากน้ำและกรรมการมหาเถรสมาคมส่วนใหญ่ก็ไม่ได้พูดอะไร มีแต่นั่งฟังเลขานุการรายงานสรุปคือสมเด็จวัดปากน้ำและกรรมการมหาเถรสมาคมไม่ได้ลงมติอะไรเลย และฟังรายงานจากเลขาฯ รายงานเสร็จเลขาฯอ้างว่าติดราชการขอกลับไปก่อน แล้วเอาเอกสารให้พระพูด พระที่รับฝากพูดจากเลขาฯจึงเป็นหมู่บ้านกระสุนตก ความจริงเป็นอย่างนี้แล้ว มติมหาเถร มีกรรมการ 20 รูป ที่เป็นข่าวว่าลงมติ 12:8 ทำให้ตอนนี้มีข้อสงสัยกันมาก ว่า กรรมการจากวัดบวรฯ วัดสัมพันธวงศ์และวัดเทพศิรินทร์ รวม 3 รูป ไม่ได้เข้าประชุม จึงมีกรรมการเพียง 17 รูป แล้วใครลงมติแทนกรรมการที่ไม่มาประชุม 3 รูป สำนักพุทธฯต้องชี้แจง ว่าเกิดอะไรขึ้น